Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCVRNP35243 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCVRNP35243 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCVRNP35243 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCVRNP35243 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCVRNP35243 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCVRNP35243 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms