Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms