Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCKARP32238 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCKARP32238 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms