Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPS1P31327 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPS1P31327 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPS1P31327 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPS1P31327 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPS1P31327 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPS1P31327 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPS1P31327 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPS1P31327 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPS1P31327 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPS1P31327 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPS1P31327 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPS1P31327 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPS1P31327 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CPS1P31327 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPS1P31327 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPS1P31327 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPS1P31327 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPS1P31327 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPS1P31327 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CPS1P31327 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPS1P31327 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPS1P31327 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPS1P31327 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPS1P31327 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPS1P31327 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CPS1P31327 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPS1P31327 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPS1P31327 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPS1P31327 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPS1P31327 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPS1P31327 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPS1P31327 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPS1P31327 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPS1P31327 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPS1P31327 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPS1P31327 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPS1P31327 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPS1P31327 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPS1P31327 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPS1P31327 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPS1P31327 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPS1P31327 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPS1P31327 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPS1P31327 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPS1P31327 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPS1P31327 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPS1P31327 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPS1P31327 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPS1P31327 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPS1P31327 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPS1P31327 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CPS1P31327 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPS1P31327 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPS1P31327 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPS1P31327 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPS1P31327 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPS1P31327 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CPS1P31327 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPS1P31327 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPS1P31327 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPS1P31327 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPS1P31327 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPS1P31327 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPS1P31327 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CPS1P31327 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPS1P31327 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CPS1P31327 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPS1P31327 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CPS1P31327 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CPS1P31327 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPS1P31327 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CPS1P31327 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPS1P31327 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPS1P31327 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPS1P31327 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPS1P31327 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPS1P31327 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPS1P31327 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPS1P31327 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CPS1P31327 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPS1P31327 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPS1P31327 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPS1P31327 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPS1P31327 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPS1P31327 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPS1P31327 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPS1P31327 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPS1P31327 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPS1P31327 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPS1P31327 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPS1P31327 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPS1P31327 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPS1P31327 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPS1P31327 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPS1P31327 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPS1P31327 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPS1P31327 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPS1P31327 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPS1P31327 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms