Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMPK1P30085 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms