Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB5P28074 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms