Protein–RNA interactions for Protein: P25942

CD40, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 5, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40P25942 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40P25942 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40P25942 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40P25942 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD40P25942 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD40P25942 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD40P25942 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD40P25942 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40P25942 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40P25942 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40P25942 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40P25942 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms