Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDSP20132 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SDSP20132 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDSP20132 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDSP20132 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDSP20132 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDSP20132 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDSP20132 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDSP20132 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDSP20132 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDSP20132 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDSP20132 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDSP20132 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDSP20132 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDSP20132 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDSP20132 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SDSP20132 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SDSP20132 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDSP20132 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDSP20132 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDSP20132 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDSP20132 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDSP20132 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDSP20132 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDSP20132 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDSP20132 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDSP20132 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDSP20132 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDSP20132 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDSP20132 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDSP20132 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDSP20132 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDSP20132 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDSP20132 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDSP20132 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDSP20132 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDSP20132 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDSP20132 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDSP20132 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDSP20132 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDSP20132 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SDSP20132 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SDSP20132 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SDSP20132 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDSP20132 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDSP20132 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDSP20132 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDSP20132 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDSP20132 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDSP20132 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDSP20132 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDSP20132 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDSP20132 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDSP20132 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDSP20132 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDSP20132 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDSP20132 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDSP20132 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDSP20132 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDSP20132 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDSP20132 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDSP20132 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDSP20132 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDSP20132 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDSP20132 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDSP20132 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDSP20132 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDSP20132 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDSP20132 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDSP20132 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDSP20132 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDSP20132 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDSP20132 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDSP20132 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDSP20132 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDSP20132 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDSP20132 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDSP20132 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDSP20132 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDSP20132 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDSP20132 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDSP20132 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDSP20132 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SDSP20132 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDSP20132 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDSP20132 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDSP20132 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDSP20132 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDSP20132 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDSP20132 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDSP20132 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDSP20132 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDSP20132 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDSP20132 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDSP20132 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDSP20132 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDSP20132 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDSP20132 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDSP20132 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDSP20132 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms