Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DPA1P20036 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms