Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
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PTPRAP18433 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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PTPRAP18433 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
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PTPRAP18433 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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PTPRAP18433 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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PTPRAP18433 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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PTPRAP18433 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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PTPRAP18433 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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PTPRAP18433 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRAP18433 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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