Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HKR1P10072 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HKR1P10072 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms