Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms