Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEFMP07197 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEFMP07197 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEFMP07197 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEFMP07197 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEFMP07197 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEFMP07197 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEFMP07197 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEFMP07197 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEFMP07197 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFMP07197 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFMP07197 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFMP07197 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFMP07197 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFMP07197 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFMP07197 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFMP07197 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFMP07197 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFMP07197 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFMP07197 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFMP07197 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFMP07197 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFMP07197 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFMP07197 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFMP07197 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFMP07197 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFMP07197 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFMP07197 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFMP07197 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFMP07197 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFMP07197 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFMP07197 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFMP07197 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFMP07197 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFMP07197 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFMP07197 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFMP07197 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFMP07197 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFMP07197 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFMP07197 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFMP07197 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFMP07197 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFMP07197 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFMP07197 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFMP07197 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFMP07197 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFMP07197 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFMP07197 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFMP07197 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFMP07197 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFMP07197 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFMP07197 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFMP07197 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFMP07197 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFMP07197 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFMP07197 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFMP07197 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFMP07197 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFMP07197 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFMP07197 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFMP07197 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFMP07197 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFMP07197 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFMP07197 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFMP07197 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFMP07197 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFMP07197 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFMP07197 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFMP07197 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFMP07197 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFMP07197 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFMP07197 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFMP07197 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFMP07197 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFMP07197 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFMP07197 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFMP07197 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFMP07197 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFMP07197 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFMP07197 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFMP07197 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFMP07197 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFMP07197 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFMP07197 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFMP07197 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFMP07197 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFMP07197 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFMP07197 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFMP07197 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms