Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD2O96028 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NSD2O96028 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NSD2O96028 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NSD2O96028 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NSD2O96028 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NSD2O96028 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NSD2O96028 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD2O96028 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD2O96028 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD2O96028 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD2O96028 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD2O96028 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD2O96028 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD2O96028 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD2O96028 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD2O96028 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD2O96028 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD2O96028 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD2O96028 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD2O96028 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD2O96028 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD2O96028 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD2O96028 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD2O96028 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD2O96028 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD2O96028 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD2O96028 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD2O96028 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD2O96028 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD2O96028 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD2O96028 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD2O96028 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD2O96028 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD2O96028 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD2O96028 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD2O96028 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD2O96028 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD2O96028 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD2O96028 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD2O96028 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD2O96028 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD2O96028 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD2O96028 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD2O96028 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD2O96028 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD2O96028 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD2O96028 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD2O96028 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD2O96028 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD2O96028 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD2O96028 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD2O96028 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD2O96028 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD2O96028 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD2O96028 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD2O96028 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD2O96028 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD2O96028 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD2O96028 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD2O96028 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD2O96028 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD2O96028 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD2O96028 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD2O96028 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD2O96028 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD2O96028 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD2O96028 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD2O96028 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD2O96028 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD2O96028 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD2O96028 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD2O96028 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD2O96028 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD2O96028 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD2O96028 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD2O96028 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD2O96028 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD2O96028 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD2O96028 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD2O96028 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD2O96028 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD2O96028 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD2O96028 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD2O96028 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD2O96028 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD2O96028 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD2O96028 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD2O96028 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD2O96028 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD2O96028 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD2O96028 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD2O96028 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD2O96028 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD2O96028 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD2O96028 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD2O96028 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD2O96028 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD2O96028 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD2O96028 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms