Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNKO75909 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms