Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCN2BO60939 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms