Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms