Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms