Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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HOXA3O43365 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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