Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTIFO43310 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTIFO43310 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTIFO43310 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTIFO43310 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTIFO43310 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTIFO43310 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTIFO43310 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTIFO43310 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTIFO43310 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTIFO43310 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTIFO43310 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTIFO43310 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTIFO43310 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTIFO43310 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTIFO43310 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CTIFO43310 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTIFO43310 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTIFO43310 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTIFO43310 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTIFO43310 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTIFO43310 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTIFO43310 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTIFO43310 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
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