Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLOCKO15516 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms