Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBDO15205 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBDO15205 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBDO15205 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBDO15205 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBDO15205 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBDO15205 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBDO15205 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBDO15205 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
UBDO15205 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBDO15205 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBDO15205 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBDO15205 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBDO15205 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBDO15205 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBDO15205 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBDO15205 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBDO15205 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
UBDO15205 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBDO15205 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBDO15205 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBDO15205 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBDO15205 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBDO15205 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBDO15205 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBDO15205 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBDO15205 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBDO15205 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBDO15205 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms