Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFIT3O14879 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFIT3O14879 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFIT3O14879 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFIT3O14879 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFIT3O14879 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFIT3O14879 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFIT3O14879 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
IFIT3O14879 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFIT3O14879 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFIT3O14879 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFIT3O14879 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFIT3O14879 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFIT3O14879 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFIT3O14879 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFIT3O14879 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFIT3O14879 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFIT3O14879 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFIT3O14879 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFIT3O14879 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFIT3O14879 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFIT3O14879 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFIT3O14879 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFIT3O14879 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IFIT3O14879 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFIT3O14879 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFIT3O14879 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFIT3O14879 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFIT3O14879 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFIT3O14879 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFIT3O14879 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFIT3O14879 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFIT3O14879 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFIT3O14879 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFIT3O14879 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFIT3O14879 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFIT3O14879 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IFIT3O14879 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IFIT3O14879 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFIT3O14879 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFIT3O14879 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFIT3O14879 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFIT3O14879 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFIT3O14879 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFIT3O14879 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFIT3O14879 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
IFIT3O14879 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFIT3O14879 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
IFIT3O14879 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFIT3O14879 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFIT3O14879 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFIT3O14879 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IFIT3O14879 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFIT3O14879 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IFIT3O14879 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IFIT3O14879 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IFIT3O14879 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFIT3O14879 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFIT3O14879 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IFIT3O14879 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFIT3O14879 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
IFIT3O14879 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFIT3O14879 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFIT3O14879 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms