Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms