Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms