Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms