Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms