Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F8A0AVK6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms