Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms