Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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