Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms