Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms