Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms