Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC4AQ9UMR7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLEC4AQ9UMR7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLEC4AQ9UMR7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLEC4AQ9UMR7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC4AQ9UMR7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC4AQ9UMR7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC4AQ9UMR7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC4AQ9UMR7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC4AQ9UMR7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC4AQ9UMR7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC4AQ9UMR7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC4AQ9UMR7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC4AQ9UMR7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC4AQ9UMR7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC4AQ9UMR7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC4AQ9UMR7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC4AQ9UMR7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC4AQ9UMR7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC4AQ9UMR7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC4AQ9UMR7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC4AQ9UMR7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms