Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms