Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms