Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms