Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms