Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGA2Q9UJY4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms