Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms