Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms