Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms