Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms