Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms