Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms