Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNW5

WDR6, WD repeat-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR6Q9NNW5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
WDR6Q9NNW5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
WDR6Q9NNW5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
WDR6Q9NNW5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
WDR6Q9NNW5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
WDR6Q9NNW5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
WDR6Q9NNW5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
WDR6Q9NNW5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
WDR6Q9NNW5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
WDR6Q9NNW5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
WDR6Q9NNW5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
WDR6Q9NNW5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms