Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC52A2Q9HAB3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms