Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF1Q9H7N4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms