Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCAS3Q9H6U6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms