Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms